Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sik1Q60670 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms