Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClpbQ60649 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms