Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sin3aQ60520 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms