Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp20Q5XG71 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp20Q5XG71 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms