Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a4Q5XF90 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a4Q5XF90 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a4Q5XF90 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a4Q5XF90 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms