Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms