Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bbs12Q5SUD9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms