Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psme4Q5SSW2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme4Q5SSW2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms