Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQF8

Sap30l, Histone deacetylase complex subunit SAP30L, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30lQ5SQF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30lQ5SQF8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms