Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Brsk1Q5RJI5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Brsk1Q5RJI5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Brsk1Q5RJI5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Brsk1Q5RJI5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Brsk1Q5RJI5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Brsk1Q5RJI5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Brsk1Q5RJI5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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