Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav6-2Q5R1I4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms