Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms