Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf1Q5ND28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms