Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms