Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1810065E05RikQ5NC41 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms