Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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