Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp22Q5DU02 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp22Q5DU02 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms