Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl5Q5DTT4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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