Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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