Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lrig2Q52KR2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms