Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q504N7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q504N7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q504N7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q504N7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q504N7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q504N7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q504N7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q504N7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q504N7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q504N7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q504N7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q504N7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q504N7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q504N7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q504N7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms