Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc84Q4VA36 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms