Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Foxn3Q499D0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxn3Q499D0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms