Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms