Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc110Q3V125 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms