Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd53Q3V0J4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms