Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr7Q3V0I2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms