Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms