Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed1Q3V009 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms