Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf48Q3US17 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf48Q3US17 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf48Q3US17 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf48Q3US17 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf48Q3US17 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf48Q3US17 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Znf48Q3US17 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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