Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms