Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbsponQ3UPR9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms