Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UPC7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UPC7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UPC7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UPC7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UPC7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UPC7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3UPC7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms