Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Tmem253Q3UNB8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmem253Q3UNB8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tmem253Q3UNB8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tmem253Q3UNB8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Tmem253Q3UNB8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Tmem253Q3UNB8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Tmem253Q3UNB8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms