Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spg7Q3ULF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spg7Q3ULF4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg7Q3ULF4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms