Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms