Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp19Q3UJD6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms