Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms