Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms