Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Greb1Q3UHK3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms