Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph3aQ3UFY4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms