Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam35aQ3UEN2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam35aQ3UEN2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms