Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll12Q3UDE2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll12Q3UDE2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll12Q3UDE2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll12Q3UDE2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll12Q3UDE2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll12Q3UDE2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms