Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pid1Q3UBG2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms