Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rnf180Q3U827 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Rnf180Q3U827 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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