Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud5Q3U2S4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud5Q3U2S4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms