Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Kdm4dQ3U2K5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms