Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms