Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms