Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Q3TTJ4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TTJ4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TTJ4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TTJ4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms