Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
D17Wsu92eQ3TT38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms